EFNA5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2X11, 3MX0, 4BK5, 4BKA, 4L0P, 4M4R

Ідентифікатори

Символи

EFNA5, AF1, EFL5, EPLG7, GLC1M, LERK7, RAGS, ephrin A5

Зовнішні ІД

OMIM: 601535 MGI: 107444 HomoloGene: 1482 GeneCards: EFNA5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• neurotrophin TRKC receptor binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activator activity • neurotrophin TRKA receptor binding • ephrin receptor binding • chemorepellent activity • neurotrophin TRKB receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• мембрана • клітинна мембрана • anchored component of external side of plasma membrane • caveola • anchored component of membrane • базальна мембрана • Адгезивні контакти • cell periphery • GABA-ergic synapse
Біологічний процес	• positive regulation of synapse assembly • GO:0097285 апоптоз • диференціація клітин • regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • positive regulation of protein phosphorylation • negative chemotaxis • regulation of actin cytoskeleton organization • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • ephrin receptor signaling pathway • regulation of microtubule cytoskeleton organization • positive regulation of collateral sprouting • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • regulation of cell-cell adhesion • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • regulation of focal adhesion assembly • regulation of cell morphogenesis • collateral sprouting • negative regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • retinal ganglion cell axon guidance • cellular response to follicle-stimulating hormone stimulus • cellular response to forskolin • activation of transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • axon guidance • synaptic membrane adhesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1946


13640

Ensembl


ENSG00000184349


ENSMUSG00000048915

UniProt


P52803


O08543

RefSeq (мРНК)


NM_001962


NM_010109 NM_207654

RefSeq (білок)


NP_001953


NP_034239 NP_997537

Локус (UCSC)

Хр. 5: 107.38 – 107.67 Mb

Хр. 17: 62.91 – 63.19 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

EFNA5 (англ. Ephrin A5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 228 амінокислот, а молекулярна маса — 26 297^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLHVEMLTLV	FLVLWMCVFS	QDPGSKAVAD	RYAVYWNSSN	PRFQRGDYHI
DVCINDYLDV	FCPHYEDSVP	EDKTERYVLY	MVNFDGYSAC	DHTSKGFKRW
ECNRPHSPNG	PLKFSEKFQL	FTPFSLGFEF	RPGREYFYIS	SAIPDNGRRS
CLKLKVFVRP	TNSCMKTIGV	HDRVFDVNDK	VENSLEPADD	TVHESAEPSR
GENAAQTPRI	PSRLLAILLF	LLAMLLTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Kozlosky C.J., Vanden Bos T., Park L.S., Cerretti D.P., Carpenter M.K. (1997). LERK-7: a ligand of the Eph-related kinases is developmentally regulated in the brain. Cytokine. 9: 540—549. PMID 9245480 DOI:10.1006/cyto.1997.0199
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nikolov D.B., Li C., Lackmann M., Jeffrey P., Himanen J.P. (2007). Crystal structure of the human ephrin-A5 ectodomain. Protein Sci. 16: 996—1000. PMID 17400922 DOI:10.1110/ps.062665807

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3225 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
↑ UniProt, P52803 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.