LHX3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2JTN, 2RGT

Ідентифікатори

Символи

LHX3, CPHD3, LIM3, M2-LIM homeobox 3

Зовнішні ІД

OMIM: 600577 MGI: 102673 HomoloGene: 7814 GeneCards: LHX3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• transcription regulator complex • внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес	• ventral spinal cord interneuron specification • диференціація клітин • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • spinal cord association neuron differentiation • spinal cord motor neuron cell fate specification • placenta development • lung development • negative regulation of apoptotic process • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • animal organ morphogenesis • inner ear development • medial motor column neuron differentiation • motor neuron axon guidance • dorsal/ventral pattern formation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8022


16871

Ensembl


ENSG00000107187


ENSMUSG00000026934

UniProt


Q9UBR4


P50481

RefSeq (мРНК)


NM_014564 NM_178138 NM_001363746


NM_001039653 NM_010711

RefSeq (білок)


NP_055379 NP_835258 NP_001350675


NP_001034742 NP_034841

Локус (UCSC)

Хр. 9: 136.2 – 136.21 Mb

Хр. 2: 26.09 – 26.1 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LHX3 (англ. LIM homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 43 358^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLETGLERD	RARPGAAAVC	TLGGTREIPL	CAGCDQHILD	RFILKALDRH
WHSKCLKCSD	CHTPLAERCF	SRGESVYCKD	DFFKRFGTKC	AACQLGIPPT
QVVRRAQDFV	YHLHCFACVV	CKRQLATGDE	FYLMEDSRLV	CKADYETAKQ
REAEATAKRP	RTTITAKQLE	TLKSAYNTSP	KPARHVREQL	SSETGLDMRV
VQVWFQNRRA	KEKRLKKDAG	RQRWGQYFRN	MKRSRGGSKS	DKDSVQEGQD
SDAEVSFPDE	PSLAEMGPAN	GLYGSLGEPT	QALGRPSGAL	GNFSLEHGGL
AGPEQYRELR	PGSPYGVPPS	PAAPQSLPGP	QPLLSSLVYP	DTSLGLVPSG
APGGPPPMRV	LAGNGPSSDL	STGSSGGYPD	FPASPASWLD	EVDHAQF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Parker G.E., West B.E., Witzmann F.A., Rhodes S.J. (2005). Serine/threonine/tyrosine phosphorylation of the LHX3 LIM-homeodomain transcription factor. J. Cell. Biochem. 94: 67—80. PMID 15517599 DOI:10.1002/jcb.20287
Colvin S.C., Malik R.E., Showalter A.D., Sloop K.W., Rhodes S.J. (2011). Model of pediatric pituitary hormone deficiency separates the endocrine and neural functions of the LHX3 transcription factor in vivo. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 173—178. PMID 21149718 DOI:10.1073/pnas.1009501108

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6595 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UBR4 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.