MDM2

MDM2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1RV1, 1T4E, 1T4F, 1YCR, 1Z1M, 2AXI, 2C6A, 2C6B, 2FOP, 2GV2, 2HDP, 2LZG, 2M86, 2MPS, 2RUH, 2VJE, 2VJF, 3EQS, 3G03, 3IUX, 3IWY, 3JZK, 3JZR, 3JZS, 3LBK, 3LBL, 3LNJ, 3LNZ, 3MQS, 3TJ2, 3TPX, 3TU1, 3V3B, 3VBG, 3VZV, 3W69, 4DIJ, 4ERE, 4ERF, 4HBM, 4HFZ, 4HG7, 4JV7, 4JV9, 4JVE, 4JVR, 4JWR, 4MDN, 4MDQ, 4OAS, 4OBA, 4OCC, 4ODE, 4ODF, 4OGN, 4OGT, 4OGV, 4OQ3, 4QO4, 4QOC, 4UMN, 4WT2, 4XXB, 4ZYC, 4ZYF, 4ZYI, 4UE1, 4UD7, 5AFG, 5HMI, 5HMK, 5HMH, 5C5A

Ідентифікатори
Символи MDM2, ACTFS, HDMX, hdm2, MDM2 proto-oncogene, LSKB
Зовнішні ІД OMIM: 164785 MGI: 96952 HomoloGene: 1793 GeneCards: MDM2
Онтологія гена
Молекулярна функція

scaffold protein binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
enzyme binding
зв'язування з іоном металу
identical protein binding
ubiquitin protein ligase binding
p53 binding
SUMO transferase activity
GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
transferase activity
ligase activity
5S rRNA binding
zinc ion binding
ribonucleoprotein complex binding
protein N-terminus binding
GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
NEDD8 ligase activity
disordered domain specific binding
protein domain specific binding
receptor serine/threonine kinase binding
peroxisome proliferator activated receptor binding
ubiquitin binding

Клітинна компонента

гіалоплазма
endocytic vesicle membrane
клітинна мембрана
синапс
ядерні тільця
цитоплазма
клітинне ядро
нуклеоплазма
ядерце
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

negative regulation of signal transduction by p53 class mediator
endocardial cushion morphogenesis
cellular response to UV-C
atrial septum development
регуляція серцевого ритму
DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest
GO:1901313 positive regulation of gene expression
blood vessel development
positive regulation of cell population proliferation
negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
response to ether
blood vessel remodeling
cellular response to hypoxia
heart valve development
cellular response to estrogen stimulus
negative regulation of apoptotic process
cellular response to organic substance
cellular response to hydrogen peroxide
response to cocaine
cardiac septum morphogenesis
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0018054 peptidyl-lysine modification
positive regulation of cell cycle
ventricular septum development
positive regulation of protein export from nucleus
response to steroid hormone
cellular response to growth factor stimulus
GO:1903362 regulation of protein catabolic process
GO:1904577 cellular response to antibiotic
negative regulation of gene expression
positive regulation of mitotic cell cycle
heart development
cellular response to alkaloid
cellular response to vitamin B1
response to magnesium ion
negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
cellular response to peptide hormone stimulus
GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound
GO:0022415 viral process
response to iron ion
регуляція експресії генів
GO:1904576 response to antibiotic
traversing start control point of mitotic cell cycle
Убіквітин-залежний протеоліз
negative regulation of protein processing
establishment of protein localization
response to toxic substance
response to morphine
atrioventricular valve morphogenesis
protein localization to nucleus
regulation of signal transduction by p53 class mediator
positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation
response to water-immersion restraint stress
negative regulation of neuron projection development
positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration
protein deubiquitination
protein sumoylation
transcription factor catabolic process
protein autoubiquitination
response to formaldehyde
protein destabilization
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
proteolysis involved in cellular protein catabolic process
cellular response to gamma radiation
cellular response to actinomycin D
negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator
amyloid fibril formation
GO:0034622 protein-containing complex assembly
ubiquitin-dependent protein catabolic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4193
17246
Ensembl
ENSG00000135679
ENSMUSG00000020184
UniProt
Q00987
P23804
RefSeq (мРНК)
NM_001145336
NM_001145337
NM_001145339
NM_001145340
NM_001278462
NM_002392
NM_006878
NM_006879
NM_006880
NM_006881
NM_006882
NM_032739
NM_001367990
NM_001288586
NM_010786
RefSeq (білок)
NP_001138809
NP_001138811
NP_001138812
NP_001265391
NP_002383
NP_001354919
NP_001275515
NP_034916
Локус (UCSC) Хр. 12: 68.81 – 68.85 Mb Хр. 10: 117.52 – 117.55 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MDM2 (англ. MDM2 proto-oncogene) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 491 амінокислот, а молекулярна маса — 55 233[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MCNTNMSVPTDGAVTTSQIPASEQETLVRPKPLLLKLLKSVGAQKDTYTM
KEVLFYLGQYIMTKRLYDEKQQHIVYCSNDLLGDLFGVPSFSVKEHRKIY
TMIYRNLVVVNQQESSDSGTSVSENRCHLEGGSDQKDLVQELQEEKPSSS
HLVSRPSTSSRRRAISETEENSDELSGERQRKRHKSDSISLSFDESLALC
VIREICCERSSSSESTGTPSNPDLDAGVSEHSGDWLDQDSVSDQFSVEFE
VESLDSEDYSLSEEGQELSDEDDEVYQVTVYQAGESDTDSFEEDPEISLA
DYWKCTSCNEMNPPLPSHCNRCWALRENWLPEDKGKDKGEISEKAKLENS
TQAEEGFDVPDCKKTIVNDSRESCVEENDDKITQASQSQESEDYSQPSTS
SSIIYSSQEDVKEFEREETQDKEESVESSLPLNAIEPCVICQGRPKNGCI
VHGKTGHLMACFTCAKKLKKRNKPCPVCRQPIQMIVLTYFP

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Oliner J.D., Kinzler K.W., Meltzer P.S., George D.L., Vogelstein B. (1992). Amplification of a gene encoding a p53-associated protein in human sarcomas. Nature. 358: 80—83. PMID 1614537 DOI:10.1038/358080a0
  • Sigalas I., Calvert A.H., Anderson J.J., Neal D.E., Lunec J. (1996). Alternatively spliced mdm2 transcripts with loss of p53 binding domain sequences: transforming ability and frequent detection in human cancer. Nat. Med. 2: 912—917. PMID 8705862 DOI:10.1038/nm0896-912
  • Veldhoen N., Metcalfe S., Milner J. (1999). A novel exon within the mdm2 gene modulates translation initiation in vitro and disrupts the p53-binding domain of mdm2 protein. Oncogene. 18: 7026—7033. PMID 10597303 DOI:10.1038/sj.onc.1203182
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zauberman A., Flusberg D., Haupt Y., Barak Y., Oren M. (1995). A functional p53-responsive intronic promoter is contained within the human mdm2 gene. Nucleic Acids Res. 23: 2584—2592. PMID 7651818 DOI:10.1093/nar/23.14.2584
  • Liang H., Atkins H., Abdel-Fattah R., Jones S.N., Lunec J. (2004). Genomic organisation of the human MDM2 oncogene and relationship to its alternatively spliced mRNAs. Gene. 338: 217—223. PMID 15315825 DOI:10.1016/j.gene.2004.05.015

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6973 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q00987 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»