NTRK2

NTRK2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4AT5, 1HCF, 1WWB, 2MFQ, 4ASZ, 4AT3, 4AT4

Ідентифікатори
Символи NTRK2, GP145-TrkB, TRKB, trk-B, neurotrophic receptor tyrosine kinase 2, OBHD, EIEE58
Зовнішні ІД OMIM: 600456 MGI: 97384 HomoloGene: 4504 GeneCards: NTRK2
Пов'язані генетичні захворювання
obesity, Hyperphagia, and developmental delay[1]
Реагує на сполуку
entrectinib, altiratinib[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• neurotrophin binding
• neurotrophin receptor activity
• kinase activity
• transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
• ATP binding
• protein kinase activity
• brain-derived neurotrophic factor binding
• transferase activity
• protein homodimerization activity
• protein tyrosine kinase activity
• nucleotide binding
• brain-derived neurotrophic factor-activated receptor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• receptor tyrosine kinase
• transmembrane signaling receptor activity

Клітинна компонента

• гіалоплазма
• ендосома
• postsynaptic membrane
• мембрана
• terminal bouton
• integral component of membrane
• receptor complex
• endosome membrane
• integral component of plasma membrane
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• early endosome
• early endosome membrane
• клітинна мембрана
• аксон
• дендрит (нейробіологія)
• perinuclear region of cytoplasm
• цитоплазма
• cell projection
• dendritic spine
• axon terminus
• Golgi membrane

Біологічний процес

• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
• peripheral nervous system neuron development
• positive regulation of protein phosphorylation
• oligodendrocyte differentiation
• навчення
• positive regulation of axonogenesis
• васкулогенез
• protein phosphorylation
• central nervous system neuron development
• neuromuscular junction development
• retinal rod cell development
• циркадний ритм
• харчова поведінка
• GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity
• positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation
• brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway
• regulation of protein kinase B signaling
• regulation of metabolic process
• positive regulation of MAPK cascade
• диференціація клітин
• фосфорилювання
• neuron migration
• mechanoreceptor differentiation
• нейробіологія розвитку
• glutamate secretion
• retina development in camera-type eye
• neuron differentiation
• cerebral cortex development
• negative regulation of anoikis
• multicellular organism development
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• positive regulation of cell population proliferation
• positive regulation of neuron projection development
• cellular response to amino acid stimulus
• positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
• peptidyl-tyrosine phosphorylation
• довготривала потенціація
• positive regulation of synapse assembly
• transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
• protein autophosphorylation
• trans-synaptic signaling by neuropeptide, modulating synaptic transmission
• activation of phospholipase C activity
• neurotrophin TRK receptor signaling pathway
• positive regulation of non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity
• trans-synaptic signaling by BDNF, modulating synaptic transmission
• negative regulation of signal transduction
• neuronal action potential propagation
• myelination in peripheral nervous system
• negative regulation of apoptotic process
• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• cellular response to nerve growth factor stimulus
• regulation of MAPK cascade
• cellular response to brain-derived neurotrophic factor stimulus

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4915
18212
Ensembl
ENSG00000148053
ENSMUSG00000055254
UniProt
Q16620
P15209
RefSeq (мРНК)
NM_001007097
NM_001018064
NM_001018065
NM_001018066
NM_001291937
NM_006180
NM_001025074
NM_008745
NM_001282961
RefSeq (білок)
NP_001007098
NP_001018074
NP_001018075
NP_001018076
NP_001278866
NP_006171
NP_001356461
NP_001356462
NP_001356463
NP_001356464
NP_001356465
NP_001356466
NP_001356467
NP_001356468
NP_001356469
NP_001356470
NP_001356471
NP_001356472
NP_001356473
NP_001356474
NP_001356475
NP_001356476
NP_001356477
NP_001356478
NP_001356479
NP_001356480
NP_001356481
NP_001020245
NP_001269890
NP_032771
Локус (UCSC) Хр. 9: 84.67 – 85.03 Mb Хр. 13: 58.95 – 59.28 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NTRK2 (англ. Neurotrophic receptor tyrosine kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 822 амінокислот, а молекулярна маса — 91 999[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSP
GIVAFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVD
SGLKFVAHKAFLKNSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPF
TCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSAN
LAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHMNETSHTQGSL
RITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDN
PTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDY
GTAANDIGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVM
LFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDA
VIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFG
KVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHREAELLTNLQHEHI
VKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNPPTELTQ
SQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRD
VYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYG
KQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNI
KGIHTLLQNLAKASPVYLDILG

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

  • Stoilov P., Castren E., Stamm S. (2002). Analysis of the human TrkB gene genomic organization reveals novel TrkB isoforms, unusual gene length, and splicing mechanism. Biochem. Biophys. Res. Commun. 290: 1054—1065. PMID 11798182 DOI:10.1006/bbrc.2001.6301
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Meakin S.O., MacDonald J.I.S., Gryz E.A., Kubu C.J., Verdi J.M. (1999). The signaling adapter FRS-2 competes with Shc for binding to the nerve growth factor receptor TrkA. A model for discriminating proliferation and differentiation. J. Biol. Chem. 274: 9861—9870. PMID 10092678 DOI:10.1074/jbc.274.14.9861
  • Luberg K., Wong J., Weickert C.S., Timmusk T. (2010). Human TrkB gene: novel alternative transcripts, protein isoforms and expression pattern in the prefrontal cerebral cortex during postnatal development. J. Neurochem. 113: 952—964. PMID 20193039 DOI:10.1111/j.1471-4159.2010.06662.x

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з NTRK2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8032 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  6. ↑ UniProt, Q16620 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 9
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.