PAPSS2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2AX4

Ідентифікатори

Символи

PAPSS2, ATPSK2, BCYM4, SK2, 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2

Зовнішні ІД

OMIM: 603005 MGI: 1330223 HomoloGene: 55840 GeneCards: PAPSS2

Пов'язані генетичні захворювання

spondyloepimetaphyseal dysplasia, Pakistani type^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ATP binding • nucleotidyltransferase activity • kinase activity • каталітична активність • nucleotide binding • transferase activity • sulfate adenylyltransferase (ATP) activity • adenylylsulfate kinase activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма
Біологічний процес	• зсідання крові • skeletal system development • bone development • фосфорилювання • обмін речовин • sulfate assimilation • 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate biosynthetic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9060


23972

Ensembl


ENSG00000198682


ENSMUSG00000024899

UniProt


O95340 Q5TB52


O88428

RefSeq (мРНК)


NM_004670 NM_001015880


NM_001201470 NM_011864 NM_001360403

RefSeq (білок)


NP_001015880 NP_004661 NP_004661.2


NP_001188399 NP_035994 NP_001347332

Локус (UCSC)

Хр. 10: 87.66 – 87.75 Mb

Хр. 19: 32.57 – 32.64 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PAPSS2 (англ. 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 614 амінокислот, а молекулярна маса — 69 501^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGIKKQKTE	NQQKSTNVVY	QAHHVSRNKR	GQVVGTRGGF	RGCTVWLTGL
SGAGKTTISF	ALEEYLVSHA	IPCYSLDGDN	VRHGLNRNLG	FSPGDREENI
RRIAEVAKLF	ADAGLVCITS	FISPFAKDRE	NARKIHESAG	LPFFEIFVDA
PLNICESRDV	KGLYKRARAG	EIKGFTGIDS	DYEKPETPER	VLKTNLSTVS
DCVHQVVELL	QEQNIVPYTI	IKDIHELFVP	ENKLDHVRAE	AETLPSLSIT
KLDLQWVQVL	SEGWATPLKG	FMREKEYLQV	MHFDTLLDDG	VINMSIPIVL
PVSAEDKTRL	EGCSKFVLAH	GGRRVAILRD	AEFYEHRKEE	RCSRVWGTTC
TKHPHIKMVM	ESGDWLVGGD	LQVLEKIRWN	DGLDQYRLTP	LELKQKCKEM
NADAVFAFQL	RNPVHNGHAL	LMQDTRRRLL	ERGYKHPVLL	LHPLGGWTKD
DDVPLDWRMK	QHAAVLEEGV	LDPKSTIVAI	FPSPMLYAGP	TEVQWHCRSR
MIAGANFYIV	GRDPAGMPHP	ETKKDLYEPT	HGGKVLSMAP	GLTSVEIIPF
RVAAYNKAKK	AMDFYDPARH	NEFDFISGTR	MRKLAREGEN	PPDGFMAPKA
WKVLTDYYRS	LEKN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

Kurima K., Singh B., Schwartz N.B. (1999). Genomic organization of the mouse and human genes encoding the ATP sulfurylase/adenosine 5'-phosphosulfate kinase isoform SK2. J. Biol. Chem. 274: 33306—33312. PMID 10559207 DOI:10.1074/jbc.274.47.33306
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Xu Z.-H., Freimuth R.R., Eckloff B., Wieben E., Weinshilboum R.M. (2002). Human 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthetase 2 (PAPSS2) pharmacogenetics: gene resequencing, genetic polymorphisms and functional characterization of variant allozymes. Pharmacogenetics. 12: 11—21. PMID 11773860 DOI:10.1097/00008571-200201000-00003

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PAPSS2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8604 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O95340 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.