POLA1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/43/Protein_POLA1_PDB_1k0p.png/250px-Protein_POLA1_PDB_1k0p.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1K0P, 1K18, 1N5G, 4Q5V, 4QCL, 4Y97, 5EXR, 5IUD | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | POLA1, NSX, POLA, p180, Polymerase (DNA directed), alpha 1, polymerase (DNA) alpha 1, catalytic subunit, DNA polymerase alpha 1, catalytic subunit, VEODS |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 312040 MGI: 99660 HomoloGene: 6802 GeneCards: POLA1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
X-linked intellectual disability, van Esch type[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a, цитарабін, Флударабін, gemcitabine hydrochloride[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • 4 iron, 4 sulfur cluster binding • nucleotidyltransferase activity • nucleoside binding • iron-sulfur cluster binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • protein kinase binding • DNA-directed DNA polymerase activity • nucleotide binding • DNA binding • DNA replication origin binding • purine nucleotide binding • protein heterodimerization activity • single-stranded DNA binding • pyrimidine nucleotide binding |
---|
Клітинна компонента | • nuclear envelope • nuclear matrix • ядерце • Хроматин • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • alpha DNA polymerase:primase complex |
---|
Біологічний процес | • DNA synthesis involved in DNA repair • lagging strand elongation • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • реплікація ДНК • leading strand elongation • проліферація • GO:0022415 viral process • double-strand break repair via nonhomologous end joining • DNA strand elongation involved in DNA replication • DNA replication, synthesis of RNA primer • telomere maintenance via semi-conservative replication • G1/S transition of mitotic cell cycle • DNA replication initiation • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleotide-excision repair • DNA synthesis involved in UV-damage excision repair • mitotic DNA replication initiation • synthesis of RNA primer involved in mitotic DNA replication |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0e/PBB_GE_POLA1_204835_at_fs.png/250px-PBB_GE_POLA1_204835_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_016937 NM_001330360 NM_001378303 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001317289 NP_058633 NP_001365232 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. X: 24.69 – 25 Mb | Хр. X: 92.35 – 92.68 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
POLA1 (англ. DNA polymerase alpha 1, catalytic subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 462 амінокислот, а молекулярна маса — 165 913[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPVHGDDSL | | SDSGSFVSSR | | ARREKKSKKG | | RQEALERLKK | | AKAGEKYKYE |
VEDFTGVYEE | | VDEEQYSKLV | | QARQDDDWIV | | DDDGIGYVED | | GREIFDDDLE |
DDALDADEKG | | KDGKARNKDK | | RNVKKLAVTK | | PNNIKSMFIA | | CAGKKTADKA |
VDLSKDGLLG | | DILQDLNTET | | PQITPPPVMI | | LKKKRSIGAS | | PNPFSVHTAT |
AVPSGKIASP | | VSRKEPPLTP | | VPLKRAEFAG | | DDVQVESTEE | | EQESGAMEFE |
DGDFDEPMEV | | EEVDLEPMAA | | KAWDKESEPA | | EEVKQEADSG | | KGTVSYLGSF |
LPDVSCWDID | | QEGDSSFSVQ | | EVQVDSSHLP | | LVKGADEEQV | | FHFYWLDAYE |
DQYNQPGVVF | | LFGKVWIESA | | ETHVSCCVMV | | KNIERTLYFL | | PREMKIDLNT |
GKETGTPISM | | KDVYEEFDEK | | IATKYKIMKF | | KSKPVEKNYA | | FEIPDVPEKS |
EYLEVKYSAE | | MPQLPQDLKG | | ETFSHVFGTN | | TSSLELFLMN | | RKIKGPCWLE |
VKSPQLLNQP | | VSWCKVEAMA | | LKPDLVNVIK | | DVSPPPLVVM | | AFSMKTMQNA |
KNHQNEIIAM | | AALVHHSFAL | | DKAAPKPPFQ | | SHFCVVSKPK | | DCIFPYAFKE |
VIEKKNVKVE | | VAATERTLLG | | FFLAKVHKID | | PDIIVGHNIY | | GFELEVLLQR |
INVCKAPHWS | | KIGRLKRSNM | | PKLGGRSGFG | | ERNATCGRMI | | CDVEISAKEL |
IRCKSYHLSE | | LVQQILKTER | | VVIPMENIQN | | MYSESSQLLY | | LLEHTWKDAK |
FILQIMCELN | | VLPLALQITN | | IAGNIMSRTL | | MGGRSERNEF | | LLLHAFYENN |
YIVPDKQIFR | | KPQQKLGDED | | EEIDGDTNKY | | KKGRKKAAYA | | GGLVLDPKVG |
FYDKFILLLD | | FNSLYPSIIQ | | EFNICFTTVQ | | RVASEAQKVT | | EDGEQEQIPE |
LPDPSLEMGI | | LPREIRKLVE | | RRKQVKQLMK | | QQDLNPDLIL | | QYDIRQKALK |
LTANSMYGCL | | GFSYSRFYAK | | PLAALVTYKG | | REILMHTKEM | | VQKMNLEVIY |
GDTDSIMINT | | NSTNLEEVFK | | LGNKVKSEVN | | KLYKLLEIDI | | DGVFKSLLLL |
KKKKYAALVV | | EPTSDGNYVT | | KQELKGLDIV | | RRDWCDLAKD | | TGNFVIGQIL |
SDQSRDTIVE | | NIQKRLIEIG | | ENVLNGSVPV | | SQFEINKALT | | KDPQDYPDKK |
SLPHVHVALW | | INSQGGRKVK | | AGDTVSYVIC | | QDGSNLTASQ | | RAYAPEQLQK |
QDNLTIDTQY | | YLAQQIHPVV | | ARICEPIDGI | | DAVLIATWLG | | LDPTQFRVHH |
YHKDEENDAL | | LGGPAQLTDE | | EKYRDCERFK | | CPCPTCGTEN | | IYDNVFDGSG |
TDMEPSLYRC | | SNIDCKASPL | | TFTVQLSNKL | | IMDIRRFIKK | | YYDGWLICEE |
PTCRNRTRHL | | PLQFSRTGPL | | CPACMKATLQ | | PEYSDKSLYT | | QLCFYRYIFD |
AECALEKLTT | | DHEKDKLKKQ | | FFTPKVLQDY | | RKLKNTAEQF | | LSRSGYSEVN |
LSKLFAGCAV | | KS |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, реплікація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК, групою 4Fe-4S, залізо-сірчаною групою. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Недостатня експресія цього гену внаслідок інтронної мутації приводить до розвитку рідкого іммунологічного синдрому Сітчастий пігментний розлад, пов'язаний з X-хромосомою, основними маніфестаціями якого є стерильне запалення, високий титр інтерферону-альфа у крові,[7] та функціональний дефект NK-клітин.[8]
Ряд екзонних мутацій у гені POLA1 може привести до розвитку інтелектуальної деградації та недорозвиненості.[9]
Література
- Pearson B.E., Nasheuer H.-P., Wang T.S.-F. (1991). Human DNA polymerase alpha gene: sequences controlling expression in cycling and serum-stimulated cells. Mol. Cell. Biol. 11: 2081—2095. PMID 2005899 DOI:10.1128/MCB.11.4.2081
- Hsi K.-L., Copeland W.C., Wang T.S.-F. (1990). Human DNA polymerase alpha catalytic polypeptide binds ConA and RCA and contains a specific labile site in the N-terminus. Nucleic Acids Res. 18: 6231—6237. PMID 2243771 DOI:10.1093/nar/18.21.6231
- Smale S.T., Tjian R. (1986). T-antigen-DNA polymerase alpha complex implicated in simian virus 40 DNA replication. Mol. Cell. Biol. 6: 4077—4087. PMID 3025630 DOI:10.1128/MCB.6.11.4077
- Lee S.S., Dong Q., Wang T.S., Lehman I.R. (1995). Interaction of herpes simplex virus 1 origin-binding protein with DNA polymerase alpha. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 7882—7886. PMID 7644508 DOI:10.1073/pnas.92.17.7882
- Braun K.A., Lao Y., He Z., Ingles C.J., Wold M.S. (1997). Role of protein-protein interactions in the function of replication protein A (RPA): RPA modulates the activity of DNA polymerase alpha by multiple mechanisms. Biochemistry. 36: 8443—8454. PMID 9214288 DOI:10.1021/bi970473r
- Dantzer F., Nasheuer H.P., Vonesch J.L., de Murcia G., Menissier-de Murcia J. (1998). Functional association of poly(ADP-ribose) polymerase with DNA polymerase alpha-primase complex: a link between DNA strand break detection and DNA replication. Nucleic Acids Res. 26: 1891—1898. PMID 9518481 DOI:10.1093/nar/26.8.1891
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з POLA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA polymerase alpha 1, catalytic subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9173 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P09884 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ Starokadomskyy, Petro; Gemelli, Terry; Rios, Jonathan J.; Xing, Chao; Wang, Richard C.; Li, Haiying; Pokatayev, Vladislav; Dozmorov, Igor; Khan, Shaheen (2016-05). DNA polymerase-α regulates the activation of type I interferons through cytosolic RNA:DNA synthesis. Nature Immunology. Т. 17, № 5. с. 495—504. doi:10.1038/ni.3409. ISSN 1529-2916. PMC 4836962. PMID 27019227. Архів оригіналу за 26 червня 2017. Процитовано 13 квітня 2020.
- ↑ Starokadomskyy, Petro; Wilton, Katelynn M.; Krzewski, Konrad; Lopez, Adam; Sifuentes-Dominguez, Luis; Overlee, Brittany; Chen, Qing; Ray, Ann; Gil-Krzewska, Aleksandra. NK cell defects in X-linked pigmentary reticulate disorder. JCI Insight. Т. 4, № 21. doi:10.1172/jci.insight.125688. ISSN 2379-3708. PMC 6948767. PMID 31672938. Процитовано 13 квітня 2020.
- ↑ Van Esch, Hilde; Colnaghi, Rita; Freson, Kathleen; Starokadomskyy, Petro; Zankl, Andreas; Backx, Liesbeth; Abramowicz, Iga; Outwin, Emily; Rohena, Luis (05 02, 2019). Defective DNA Polymerase α-Primase Leads to X-Linked Intellectual Disability Associated with Severe Growth Retardation, Microcephaly, and Hypogonadism. American Journal of Human Genetics. Т. 104, № 5. с. 957—967. doi:10.1016/j.ajhg.2019.03.006. ISSN 1537-6605. PMC 6506757. PMID 31006512. Архів оригіналу за 8 травня 2020. Процитовано 13 квітня 2020.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |