Protein ribosome 60S L5

RPL5
Cấu trúc được biết đến
PDBTìm trên Human UniProt: PDBe RCSB
Danh sách mã id PDB

4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC

Mã định danh
Danh phápRPL5, DBA6, L5, PPP1R135, MSTP030, Ribosomal protein L5, uL18
ID ngoàiOMIM: 603634 HomoloGene: 110649 GeneCards: RPL5
Mẫu hình biểu hiện RNA




Thêm nguồn tham khảo về sự biểu hiện
Bản thể gen
Chức năng phân tử rRNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
RNA binding
structural constituent of ribosome
mRNA 3'-UTR binding
5S rRNA binding
ubiquitin protein ligase binding
mRNA 5'-UTR binding
GO:0090645, GO:0061637 ubiquitin ligase inhibitor activity
Thành phần tế bào tế bào chất
cytosol
ribosome
membrane
focal adhesion
nội bào
Hạch nhân
cytosolic large ribosomal subunit
extracellular exosome
nhân tế bào
Chất nhân
Mạng lưới nội chất
GO:0009327 protein-containing complex
Xynap
ribonucleoprotein complex
Quá trình sinh học viral transcription
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
ribosomal large subunit biogenesis
translational initiation
nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
rRNA processing
ribosomal large subunit assembly
sinh tổng hợp protein
GO:1901313 positive regulation of gene expression
positive regulation of translation
protein stabilization
GO:0060564, GO:1904190 negative regulation of ubiquitin protein ligase activity
negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process
negative regulation of protein neddylation
regulation of signal transduction by p53 class mediator
Nguồn: Amigo / QuickGO
Gen cùng nguồn
LoàiNgườiChuột
Entrez

6125

n/a

Ensembl

ENSG00000122406

n/a

UniProt

P46777
Q5T7N0

n/a

RefSeq (mRNA)

NM_000969

n/a

RefSeq (protein)

NP_000960

n/a

Vị trí gen (UCSC)n/an/a
PubMed[1]n/a
Wikidata
Xem/Sửa Người

Protein ribosome 60S L5 là một protein ở người thì được mã hóa bởi gen RPL5.[2][3]

Chức năng

Ribosome, phức hợp mà xúc tác cho quá trình tổng hợp protein, bao gồm một tiểu đơn vị 40S nhỏ và một tiểu đơn vị 60S lớn. Các tiểu đơn vị này bao gồm bốn loại RNA và khoảng 80 protein riêng biệt về mặt cấu trúc. Gen này mã hóa một protein ribosome này là một thành phần của tiểu đơn vị 60S. Protein thuộc họ L18P trong các protein ribosome. Protein này nằm trong tế bào chất. Protein liên kết với rRNA 5S để tạo thành một phức hợp ổn định được gọi là hạt ribonucleoprotein 5S (RNP- ribonucleoprotein particle). Phức hệ này cần thiết cho việc vận chuyển rRNA 5S không gắn ribosome đến nhân con để lắp ráp thành ribosome. Protein tương tác riêng với tiểu đơn vị beta của casein kinase 2.

Ý nghĩa y khoa

Những biểu hiện bất thường của gen này trong ung thư đại trực tràng so với mô bình thường liền kề đã được quan sát thấy, mặc dù mối tương quan giữa mức độ biểu hiện và mức độ nghiêm trọng của bệnh thì còn chưa rõ ràng. Gen này được đồng phiên mã với gen RNA U21 hạt nhân nhỏ, nằm ở intron thứ năm của nó. Như là điển hình cho các gen mã hóa protein ribosome, có nhiều gen giả của gen này được nhân lên và phát tán khắp hệ gen.[4]

Tương tác

Protein ribosome 60S L5 được cho là có thể tương tác với:

Chú thích

  1. ^ “Human PubMed Reference:”.
  2. ^ Qu LH, Nicoloso M, Michot B, Azum MC, Caizergues-Ferrer M, Renalier MH, Bachellerie JP (tháng 11 năm 1994). “U21, a novel small nucleolar RNA with a 13 nt. complementarity to 28S rRNA, is encoded in an intron of ribosomal protein L5 gene in chicken and mammals”. Nucleic Acids Res. 22 (20): 4073–81. doi:10.1093/nar/22.20.4073. PMC 331892. PMID 7937132.
  3. ^ Frigerio JM, Dagorn JC, Iovanna JL (tháng 7 năm 1995). “Cloning, sequencing and expression of the L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 and S29 human ribosomal protein mRNAs”. Biochim Biophys Acta. 1262 (1): 64–8. doi:10.1016/0167-4781(95)00045-i. PMID 7772601.
  4. ^ “Entrez Gene: RPL5 ribosomal protein L5”.
  5. ^ Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (tháng 1 năm 2004). “Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region”. Genomics. 83 (1): 153–67. doi:10.1016/s0888-7543(03)00235-0. PMID 14667819.
  6. ^ Boldyreff B, Issinger OG (tháng 2 năm 1997). “A-Raf kinase is a new interacting partner of protein kinase CK2 beta subunit”. FEBS Lett. 403 (2): 197–9. doi:10.1016/s0014-5793(97)00010-0. PMID 9042965.
  7. ^ Kim JM, Cha JY, Marshak DR, Bae YS (tháng 9 năm 1996). “Interaction of the beta subunit of casein kinase II with the ribosomal protein L5”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 226 (1): 180–6. doi:10.1006/bbrc.1996.1330. PMID 8806611.
  8. ^ Ahn BH, Kim TH, Bae YS (tháng 10 năm 2001). “Mapping of the interaction domain of the protein kinase CKII beta subunit with target proteins”. Mol. Cells. 12 (2): 158–63. PMID 11710515.
  9. ^ Schatz O, Oft M, Dascher C, Schebesta M, Rosorius O, Jaksche H, Dobrovnik M, Bevec D, Hauber J (tháng 2 năm 1998). “Interaction of the HIV-1 rev cofactor eukaryotic initiation factor 5A with ribosomal protein L5”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (4): 1607–12. doi:10.1073/pnas.95.4.1607. PMC 19115. PMID 9465063.
  10. ^ Zhang Y, Wolf GW, Bhat K, Jin A, Allio T, Burkhart WA, Xiong Y (tháng 12 năm 2003). “Ribosomal protein L11 negatively regulates oncoprotein MDM2 and mediates a p53-dependent ribosomal-stress checkpoint pathway”. Mol. Cell. Biol. 23 (23): 8902–12. doi:10.1128/mcb.23.23.8902-8912.2003. PMC 262682. PMID 14612427.
  11. ^ Marechal V, Elenbaas B, Piette J, Nicolas JC, Levine AJ (tháng 11 năm 1994). “The ribosomal L5 protein is associated with mdm-2 and mdm-2-p53 complexes”. Mol. Cell. Biol. 14 (11): 7414–20. doi:10.1128/mcb.14.11.7414. PMC 359276. PMID 7935455.
  12. ^ Dai MS, Sun XX, Lu H (tháng 7 năm 2008). “Aberrant expression of nucleostemin activates p53 and induces cell cycle arrest via inhibition of MDM2”. Mol. Cell. Biol. 28 (13): 4365–76. doi:10.1128/MCB.01662-07. PMC 2447154. PMID 18426907.
  13. ^ Kang MJ, Ahn HS, Lee JY, Matsuhashi S, Park WY (tháng 4 năm 2002). “Up-regulation of PDCD4 in senescent human diploid fibroblasts”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 293 (1): 617–21. doi:10.1016/S0006-291X(02)00264-4. PMID 12054647.
  • x
  • t
  • s
Tổng hợp protein: Dịch mã (Vi khuẩn, Vi sinh vật cổ, Nhân thực)
Protein
Yếu tố mở đầu
Vi khuẩn
  • PIF-1
  • PIF-2
  • PIF-3
Vi sinh vật cổ
  • aIF1
  • aIF2
  • aIF5
  • aIF6
Nhân thực
eIF1
  • eIF1
  • EIF1AX
  • AY
  • 1B
eIF2
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • EIF2B1
  • EIF2B2
  • EIF2B3
  • EIF2B4
  • EIF2B5
  • EIF-2 kinase
  • eIF2A
  • eIF2D
eIF3
  • EIF3A
  • B
  • C
  • D
  • E
  • F
  • G
  • H
  • I
  • J
  • K
  • L
  • M
eIF4
  • EIF4A2
  • A3
  • B
  • E1
  • E2
  • E3
  • G1
  • G2
  • G3
  • H
eIF5
  • EIF5
  • EIF5A
  • A2
  • 5B
eIF6
  • EIF6
Yếu tố kéo dài
Vi khuẩn
Vi sinh vật cổ
  • aEF-1
  • aEF-2
Nhân thực
  • EEF-1
    • EEF1A1
    • EEF1A2
    • EEF1A3
    • EEF1B1
    • EEF1B2
    • EEF1B3
    • EEF1B4
    • EEF1D
    • EEF1E1
    • EEF1G
  • EEF2
Yếu tố giải phóng
Protein của ribosome
Bào tương
Tiểu phần 60S
  • RPL3
  • RPL4
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10-like
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL40
  • RPL41
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RRP15-like
  • RSL24D1
Tiểu phần 40S
  • RPSA
  • RPS2
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4 (RPS4X, RPS4Y1, RPS4Y2)
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS30
  • RACK1
Ty thể
Tiểu phần 39S
  • MRPL1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 17
  • 18
  • 19
  • 20
  • 21
  • 22
  • 23
  • 24
  • 25
  • 26
  • 27
  • 28
  • 29
  • 30
  • 31
  • 32
  • 33
  • 34
  • 35
  • 36
  • 37
  • 38
  • 39
  • 40
  • 41
  • 42
Tiểu phần 28S
  • MRPS1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 17
  • 18
  • 19
  • 20
  • 21
  • 22
  • 23
  • 24
  • 25
  • 26
  • 27
  • 28
  • 29
  • 30
  • 31
  • 32
  • 33
  • 34
  • 35
Một số khái niệm khác