CDH2

CDH2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1NCG, 1NCH, 1NCI, 1NCJ, 1OP4, 2QVI, 3Q2W, 4NUM, 4NUP, 4NUQ

Ідентифікатори
Символи CDH2, CD325, CDHN, CDw325, NCAD, cadherin 2, ACOGS, ARVD14
Зовнішні ІД OMIM: 114020 MGI: 88355 HomoloGene: 20424 GeneCards: CDH2
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• calcium ion binding
• gamma-catenin binding
• зв'язування з іоном металу
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• enzyme binding
• protein phosphatase binding
• alpha-catenin binding
• protein kinase binding
• beta-catenin binding
• identical protein binding
• cytoskeletal protein binding
• protein homodimerization activity
• cadherin binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• integral component of membrane
• мембрана
• intercalated disc
• cell-cell junction
• focal adhesion
• plasma membrane raft
• Адгезивні контакти
• клітинна мембрана
• синапс
• basolateral plasma membrane
• apical plasma membrane
• cortical actin cytoskeleton
• catenin complex
• fascia adherens
• екзосома
• lamellipodium
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• Сарколема
• endoplasmic reticulum lumen
• cell surface
• міжклітинні контакти
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• integral component of plasma membrane
• neuron projection
• apical part of cell
• collagen-containing extracellular matrix
• integral component of presynaptic active zone membrane
• integral component of postsynaptic specialization membrane

Біологічний процес

• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
• heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
• blood vessel morphogenesis
• homeostasis of number of cells
• positive regulation of muscle cell differentiation
• regulation of postsynaptic density protein 95 clustering
• glial cell differentiation
• neuroepithelial cell differentiation
• cell-cell adhesion mediated by cadherin
• radial glial cell differentiation
• neuronal stem cell population maintenance
• regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation
• telencephalon development
• neuroligin clustering involved in postsynaptic membrane assembly
• positive regulation of synaptic vesicle clustering
• адгезія клітин
• regulation of signal transduction
• cerebral cortex development
• striated muscle cell differentiation
• adherens junction organization
• cell migration
• negative regulation of canonical Wnt signaling pathway
• positive regulation of MAPK cascade
• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
• brain morphogenesis
• посттрансляційна модифікація
• protein localization to plasma membrane
• GO:0000767 cell morphogenesis
• cell-cell junction assembly
• synapse assembly
• regulation of axonogenesis
• regulation of synaptic transmission, glutamatergic
• cell-cell adhesion

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1000
12558
Ensembl
ENSG00000170558
ENSMUSG00000024304
UniProt
P19022
P15116
RefSeq (мРНК)
NM_001308176
NM_001792
NM_007664
RefSeq (білок)
NP_001295105
NP_001783
NP_001783.2
NP_031690
Локус (UCSC) Хр. 18: 27.93 – 28.18 Mb Хр. 18: 16.72 – 16.94 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CDH2 (англ. Cadherin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 906 амінокислот, а молекулярна маса — 99 809[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MCRIAGALRTLLPLLAALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYSAVLSKDVH
EGQPLLNVKFSNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHA
KFLIYAQDKETQEKWQVAVKLSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKH
SGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGP
GADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDINGNQVENP
IDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNAL
NGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQ
ATDMEGNPTYGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIV
ANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPI
DFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPN
PKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPANWLKIDPVN
GQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDIND
NAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKR
NWTITRLNGDFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKV
CQCDSNGDCTDVDRIVGAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRD
KERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDA
IKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEGLKAADNDPTAP
PYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFKKLADM
YGGGDD

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

  • Reid R.A., Hemperly J.J. (1990). Human N-cadherin: nucleotide and deduced amino acid sequence. Nucleic Acids Res. 18: 5896—5896. PMID 2216790 DOI:10.1093/nar/18.19.5896
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Wallis J.A., Fox M., Walsh F.S. (1994). Structure of the human N-cadherin gene: YAC analysis and fine chromosomal mapping to 18q11.2. Genomics. 22: 172—179. PMID 7959764 DOI:10.1006/geno.1994.1358
  • Bhatt A.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Craik C.S., Moasser M.M. (2005). Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases. Oncogene. 24: 5333—5343. PMID 16007225 DOI:10.1038/sj.onc.1208582
  • Salomon D., Ayalon O., Patel-King R., Hynes R.O., Geiger B. (1992). Extrajunctional distribution of N-cadherin in cultured human endothelial cells. J. Cell Sci. 102: 7—17. PMID 1500442

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1759 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P19022 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 18
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350