Rekombinaza

Rekombinaze su genetički rekombinatni enzimi. DNK rekombinaze su u širokoj upotrebi u multičelijskim organizmima za manipulaciju strukture genoma, i za kontrolu ekspresije gena. Ovi enzimi, izvedeni iz bakterija i gljiva, katalizuju direkciono senzitivne reakcije DNK razmene imeđu kratkih (30–40 nukleotida) ciljnih sekvenci koje su specifične za svaku rekombinazu. Te reakcije omogućavaju četiri osnovna funkcionalna modula, isecanje/umetanje, inverziju, translokaciju i kasetnu razmenu, koje su korištene individualno ili u kombinaciji u širokom nizu konfiguracija za kontrolu ekspresije gena.^[1]^[2]^[3]^[4]

Tipovi rekombinaza su:

Reference

↑ Aljoscha Nern, Barret D. Pfeiffer, Karel Svoboda, and Gerald M. Rubin (August 2011). „Multiple new site-specific recombinases for use in manipulating animal genomes”. PNAS 108 (34): 14198-14203. DOI:10.1073/pnas.1111704108.
↑ García-Otín AL, Guillou F (2006) Mammalian genome targeting using site-specific recombinases. Front Biosci 11:1108–1136.
↑ Dymecki SM, Kim JC (2007) Molecular neuroanatomy’s “Three Gs”: A primer. Neuron 54:17–34.
↑ Luan H, White BH (2007) Combinatorial methods for refined neuronal gene targeting. Curr Opin Neurobiol 17:572–580.

Spoljašnje veze

MeSH Recombinases

Transferaze: fosfor-sadržavajuće grupe (EC 2.7)

2.7.1-2.7.4:
fosfotransferaze/kinaze
(PO₄)

2.7.1: OH- akceptor	Hekso- • Gluko- • Frukto- (Hepatička) • Galakto- • Fosfofrukto- (1, Jetra, Mišić, Trombocit, 2) • Riboflavin • Šikimat • Timidin (ADP-timidin) • NAD⁺ • Glicerol • Pantotenat • Mevalonat • Piruvat • Deoksicitidin • PFP • Diacilglocerol • Fosfoinozitid 3 (Klasa I PI 3, Klasa II PI 3) • Sfingozin • Glukoza-1,6-bisfosfat sintaza
2.7.2: COOH akceptor	Fosfoglicerat • Aspartat
2.7.3: N akceptor	Kreatin
2.7.4: PO₄ akceptor	Fosfomevalonat • Adenilat • Nukleozid-difosfat

2.7.6: difosfotransferaze
(P₂O₇)

Riboza-fosfat difosfokinaza • Tiaminska pirofosfokinaza

2.7.7: nukleotidiltransferaza
(PO₄-nukleozid)

Polimeraza

DNK polimeraza	DNK-usmerena DNK polimeraza: DNK polimeraza I • DNA polimeraza II • DNA polimeraza III holoenzim RNK-usmerena DNA polimeraza: Reverzna transkriptaza (Telomeraza) DNK nukleotidileksotransferaza/Terminalna deoksinukleotidil transferaza
RNK nukleotidiltransferaza	RNK polimeraza/DNK-usmerena RNK polimeraza: RNK polimeraza I • RNK polimeraza II • RNK polimeraza III • RNK polimeraza IV • Primaza • RNK-zavisna RNK polimeraza PNPaza

Fosforolitička
3' do 5' eksoribonukleaza

RNaza PH • PNPaze

Uridililtransferaza

Glukoza-1-fosfat uridililtransferaza • Galaktoza-1-fosfat uridililtransferaza

Guanililtransferaza

iRNK završavajući enzim

Druge

Rekombinaza (Integraza) • Transpozaza

2.7.8: razno

Fosfatidiltransferaze	CDP-diacilglicerol—glicerol-3-fosfat 3-fosfatidiltransferaza • CDP-diacilglicerol—serin O-fosfatidiltransferaza • CDP-diacilglicerol—inozitol 3-fosfatidiltransferaza • CDP-diacilglicerol—holin O-fosfatidiltransferaza
Glikozil-1-fosfotransferaza	N-acetilglukozamin-1-fosfat transferaza

2.7.10-2.7.13: proteinske kinaze
(PO₄; proteinski akceptor)

2.7.10: proteinske-tirozinske	vidi tirozinske kinaze
2.7.11: proteinske-serin/treonin	vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.12: dualna specifičnost	vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.13: protein-histidinske	Protein-histidinske pros-kinaze • Proteinske-histidinske tele-kinaze • Histidinske kinaze

B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6